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使用NeXT Personal技術NSCLC ctDNA實例說明
手術前初始ctDNA測量對RFS和OS的預測能力
研究對象:
早期NSCLC患者,共171人,分為兩組:LUAD(肺腺癌,97人)和非LUAD(74人)
收集手術前的血液樣本,中位隨訪時間為5年
患者特徵:
年齡:LUAD組平均67.3歲,非LUAD組平均70.1歲
性別:兩組都是男性略多於女性
病期:從IA到IIIA期都有,LUAD組IIIA期比例較高(35.1%)
吸菸狀況:兩組都以前吸菸者為主,LUAD組有較多最近戒菸者
治療情況:兩組接受手術後輔助治療的比例相近(LUAD 48.5%,非LUAD 47.3%)
亞型分類:提供了LUAD的詳細亞型分類,以實體型最多(41.2%),其次是腺泡型(19.6%)。LUAD組全為腺癌,非LUAD組主要為鱗狀細胞癌(75.7%)
【實例說明-NSCLC】分析方法
本次研究改變方法,改用NeXT Personal技術,分析手術前的血液ctDNA
主要發現:
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ctDNA檢測範圍從1.7到253,826 PPM(百萬分之)
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在81%的LUAD 患者和100%的非LUAD患者中檢測到術前ctDNA
比較:
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與之前的研究方法相比,本研究使用NeXT Personal技術大幅提高了ctDNA的檢出率
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特別是在早期(I期)LUAD患者中,檢出率從13%提高到了52%
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總體而言,隨著LUAD分期的升高,ctDNA檢出率也隨之增加
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非LUAD患者在所有分期都達到了100%的檢出率
【實例說明-NSCLC】結果
手術前初始ctDNA測量對RFS和OS的預測能力
生存曲線分析:
左圖(RFS)和右圖(OS)都顯示三組患者(ctDNA未檢出、低、高)有明顯的生存差異。
ctDNA未檢出組的生存曲線幾乎是一條水平線,表明這組患者有極佳的預後。
ctDNA高組在早期就出現急劇下降,顯示這些患者有較高的早期復發和死亡風險。
統計顯著性:
RFS的p值(3.57e-5)比OS的p值(0.00055)更小,表明ctDNA狀態對預測復發的能力可能比預測總生存更強。
風險比(HR)分析:
RFS方面,高ctDNA組(HR=20.8)比低ctDNA組(HR=13.7)風險更高。
OS方面,高ctDNA組(HR=23.6)比低ctDNA組(HR=9.1)風險更高。
*信賴區間(CI)較寬,可能是由於樣本量較小或存在其他影響因素。
【實例說明-NSCLC】技術比較
參考Abbosh et al., 2023, Nature的檢測極限80 PPM當作一個閥值。也就是以ctDNA 80 PPM為切點,將患者分為兩組:ctDNA ≤80PPM組、ctDNA未檢出組 (採用NeXT Personal技術)
生存曲線分析:
左圖:無復發生存率(RFS) 右圖:總生存率(OS)
綠線:ctDNA未檢出組 灰線:ctDNA ≤80PPM組
統計顯著性:
RFS:p = 4.40e-5(高度顯著)
OS:p = 0.0017(顯著)
結果解讀:
ctDNA未檢出組表現出極佳的預後:RFS曲線在5年後仍接近100%,OS曲線在5年時保持100%
ctDNA ≤80PPM組雖然ctDNA很低,但預後明顯較差:RFS在5年時降至約30%,
OS在5年時降至約60%
NeXT Personal技術能夠在80 PPM以下進行有效的風險分層,展現NeXT Personal在極低ctDNA濃度檢測和患者風險分層方面的優越性能。
這種高靈敏度對於早期癌症檢測和微小殘留病變(MRD)監測特別重要。
【實例說明-NSCLC】Landmark分析的挑戰
在NSCLC患者中,手術後(無論是否接受輔助治療)血液中的ctDNA通常極低,這使得Landmark分析具有一定挑戰性,具體挑戰包括:
低ctDNA濃度:手術移除了大部分腫瘤組織,導致血液中殘留的腫瘤DNA極少,這對檢測技術的靈敏度提出了很高的要求。
檢測靈敏度要求高:需要非常高靈敏度的技術才能檢測到這些極微量的ctDNA。
偽陰性風險高:由於ctDNA濃度低,容易出現假陰性結果,這可能導致復發風險的低估。
個體差異大:每個患者的ctDNA釋放模式可能有所不同,進一步增加了分析的複雜性。
NeXT Personal技術的優勢:
NeXT Personal技術在TRACERx研究中展示了迄今為止最佳的整體Landmark表現。
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預測優勢:對於Landmark陽性患者,該技術能比影像學檢查提前約11個月(中位數)檢測到復發。
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提前預測時間:相較於之前的TRACERx研究,NeXT Personal的中位預測時間提前了約3個月,顯示出顯著的技術改進。
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生存曲線分析:
左圖:無復發生存期(RFS)Landmark陽性(灰線)患者的預後顯著較差,風險比(HR)為5.46,顯示出高度統計學意義。
右圖:總體生存期(OS)同樣,Landmark陽性患者的總體生存期也明顯較差,HR為5.64,統計學意義強烈。 -
預測能力:NeXT Personal技術能夠有效預測5年RFS和OS,為長期預後評估提供了強有力的工具。
為什麼研發抗癌藥物的可以考慮採用美國Personalis NeXT Personal技術來監測藥物反應
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超高靈敏度 - 檢測極限到1 PPM(百萬分之一)的ctDNA - 能夠識別極低的殘留腫瘤細胞 - 更早、更準確地評估藥物效果
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全面性 - 同時追蹤多達1800個突變 - 提供更全面的腫瘤基因組訊息 - 有助於理解藥物對不同基因突變的影響
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定量分析 - 不僅檢測MRD的存在,還提供定量的腫瘤負荷測量 - 精確追蹤藥物治療過程中腫瘤負荷的變化
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早期療效評估 - 可在傳統影像學方法之前數月檢測到藥物反應 - 大大縮短藥物療效評估時間
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耐藥性監測 - 監測90個關鍵基因 - 及早發現耐藥性突變 - 幫助及時調整藥物策略或開發新的靶向藥物
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亞群分析 - 根據不同的基因突變類型對患者進行分組 - 幫助識別對特定藥物反應更好的患者亞群
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減少臨床試驗成本 - 縮短臨床試驗週期 - 減少不必要的後期試驗 - 降低整體研發成本
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優化患者選擇 - 更準確地識別適合特定藥物的患者群體 - 減少在不適合的患者身上進行試驗的成本浪費
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減少後續檢查成本 - 早期檢測到MRD,可能減少對昂貴影像學檢查的依賴
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長期經濟效益 - 雖然初始成本可能較高,但長期來看可能更具成本效益 - 可能帶來臨床試驗加速和更高的成功率
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加速藥物開發週期 - 提供更早期和更精確的療效數據 - 加速決策過程 - 縮短整體藥物開發時間
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快速識別有效療法 - 更快地確定有效和無效的治療方案 - 加速有前景的藥物的開發進程
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縮短患者隨訪時間 - 傳統方法可能需要數年隨訪 - 使用NeXT Personal可能在幾個月內得到可靠的療效指標
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快速報告生成 - 7-10天內生成後續時間點的報告 - 快速的數據反饋對於動態調整研究策略至關重要