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MRD-1

超高靈敏ctDNA檢測技術
用在識別乳癌MRD

檢測極限達到 1 PPM （即0.0001%的ctDNA比例）

特異性大於99.98%，避免偽陽性／偽陰性結果
【實例說明-乳癌】分析方法 

病人選擇: 研究最初包含89名患者，最終符合分析標準的患者共有78名。樣本處理: 分析這78名患者的血液樣本，共收集了619個樣本，每位患者平均8個樣本（範圍為2至14個樣本）。隨訪結果: 15名患者發生了復發，其中有4名患者在基線後沒有進行樣本收集，其餘11名患者在隨訪期間出現復發。619個血液樣本中的分析成功率很高，病人中位隨訪時間為76個月（範圍為5至113個月）。病人的特徵包括診斷時的年齡、停經狀況、淋巴結狀態、組織學亞型、腫瘤分級、受體亞型、病理完全緩解（pCR）等。
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【實例說明-乳癌】結果
超靈敏範圍的檢測：39%的檢測（115的45）位於超靈敏範圍，即低於100 PPM（約等於0.01% TF）。這表示這種檢測方法能夠偵測到非常微量的ctDNA。
術後檢測的靈敏度：45%的術後檢測（40的18）位於超靈敏範圍。這點您解釋得很正確，顯示了這種方法在術後監測中的高度敏感性。
檢測的中位數值：中位檢測值為366 PPM，範圍從3.73到112,011 PPM。這確實顯示了ctDNA比例的巨大變異性，可能反映了不同的腫瘤負荷和疾病階段。
首次分子復發檢測：在首次檢測到分子層面復發時，ctDNA的中位值為13.1 PPM（範圍為2.28-14,204 PPM）。這個數值比整體中位數低得多，表明這種方法能夠在很早期就檢測到復發的跡象。
 

  • 圖表顯示了基線檢測（黑點）和治療中檢測（藍點）的ctDNA分佈。

  • 紅線標示了100 PPM的閾值，用於區分超靈敏範圍。

  • Y軸使用對數刻度，有助於顯示大範圍的差異

  • 傳統的定序技術（如Sanger）通常只能檢測到約20%（200,000 PPM）的突變頻率。

  • NGS定序提高了靈敏度，但大多數常規NGS平台的檢測極限約在1-5%（10,000-50,000 PPM）之間。

  • 100 PPM相當於0.01%，這已經遠低於大多數標準定序技術的檢測極限。

【實例說明-乳癌】結果 

基線樣本採集：64%（50/78）的患者有取得基線樣本，這是在治療前採集的。
ctDNA檢測率：98%（49/50）的基線樣本檢測到了ctDNA，幾乎在治療前都已經可檢測到的腫瘤DNA存在於血液中。檢測到的ctDNA的中位數為1,225 PPM，這表示ctDNA的含量在樣本中相對較高，但不同患者之間差異很大，範圍從3.73 PPM到112,011.1 PPM不等。
無復發存活期（RFS）和總體存活期（OS）的分析：患者根據ctDNA值被分為兩組：PPM >= 10000和PPM < 10000。RFS分析顯示，在60個月時，PPM < 10000組的無復發存活率為90%，而PPM >= 10000組為50%。OS分析顯示類似的趨勢，PPM < 10000組在60個月時的存活率為91.9%。
風險比（Hazard Ratio, HR）分析：RFS的HR為4.82（95% CI: 1.35-17.21），表示高ctDNA組的復發風險較高。OS的HR為5.58（95% CI: 1.49-20.98），表示高ctDNA組的死亡風險較高。
連續風險模型：使用對數轉換後的基線PPM值進行分析。
RFS的HR為1.82（95% CI: 0.99-3.35，Wald p-value = 0.05）
OS的HR為2.19（95% CI: 1.03-4.66，Wald p-value = 0.04）
這表明ctDNA的增加與較高的復發和死亡風險相關。
統計顯著性：Log-rank檢驗顯示，RFS和OS的差異在統計上是顯著的（p值分別為0.008和0.004）。
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【實例說明-乳癌】結果

中位提前期為15個月：ctDNA檢測能夠比臨床上通過影像學或其他傳統分子檢測方法檢測到腫瘤復發提早大約15個月。
中位整體存活期（Median Overall Survival）為62個月：在那些ctDNA檢測呈陽性的患者中，半數患者的存活時間達到或超過了62個月。在ctDNA檢測呈陰性的患者中，超過半數的患者在研究結束時仍然存活，因此無法取得確切的中位存活期。
【實例說明-乳癌】結果

MRD陰性（未檢測到ctDNA）：在圖表中用空心圓圈(○)表示，77%的患者未檢測到ctDNA，且沒有復發。
MRD陽性（檢測到ctDNA）：在圖表中用實心圓點(●)表示。14%的患者檢測到ctDNA並最終復發，這表明檢測到ctDNA的患者有更高的復發風險。

- 圖表中的每一行代表一個患者，橫軸表示從手術開始的月數。
- 除了MRD狀態，圖表還顯示了其他資訊，如復發(▼)、死亡(■)等事件。
- 患者被分類為不同的亞型：HR+HER2-、HER2+、TNBC等。
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乳癌MRD陽性的患者顯示出顯著較差的無復發存活期(RFS)和整體存活期(OS)，Log-rank檢定p值均小於0.001，顯示Personalis NeXT Personal技術測出的MRD與患者的預後密切相關。

青年科學家

為什麼研發抗癌藥物的可以考慮採用美國Personalis NeXT Personal技術來監測藥物反應

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  • 超高靈敏度 - 檢測極限到1 PPM（百萬分之一）的ctDNA - 能夠識別極低的殘留腫瘤細胞 - 更早、更準確地評估藥物效果
     

  • 全面性 - 同時追蹤多達1800個突變 - 提供更全面的腫瘤基因組訊息 - 有助於理解藥物對不同基因突變的影響
     

  • 定量分析 - 不僅檢測MRD的存在，還提供定量的腫瘤負荷測量 - 精確追蹤藥物治療過程中腫瘤負荷的變化
     

  • 早期療效評估 - 可在傳統影像學方法之前數月檢測到藥物反應 - 大大縮短藥物療效評估時間
     

  • 耐藥性監測 - 監測90個關鍵基因 - 及早發現耐藥性突變 - 幫助及時調整藥物策略或開發新的靶向藥物
     

  • 亞群分析 - 根據不同的基因突變類型對患者進行分組 - 幫助識別對特定藥物反應更好的患者亞群
     

  • 減少臨床試驗成本 - 縮短臨床試驗週期 - 減少不必要的後期試驗 - 降低整體研發成本
     

  • 優化患者選擇 - 更準確地識別適合特定藥物的患者群體 - 減少在不適合的患者身上進行試驗的成本浪費
     

  • 減少後續檢查成本 - 早期檢測到MRD，可能減少對昂貴影像學檢查的依賴
     

  • 長期經濟效益 - 雖然初始成本可能較高，但長期來看可能更具成本效益 - 可能帶來臨床試驗加速和更高的成功率
     

  • 加速藥物開發週期 - 提供更早期和更精確的療效數據 - 加速決策過程 - 縮短整體藥物開發時間
     

  • 快速識別有效療法 - 更快地確定有效和無效的治療方案 - 加速有前景的藥物的開發進程
     

  • 縮短患者隨訪時間 - 傳統方法可能需要數年隨訪 - 使用NeXT Personal可能在幾個月內得到可靠的療效指標
     

  • 快速報告生成 - 7-10天內生成後續時間點的報告 - 快速的數據反饋對於動態調整研究策略至關重要

NeXT Personal展現在極低ctDNA濃度檢測和患者風險分層方面的優越性能。這種高靈敏度技術對於癌症進展監測和微小殘留病變（MRD）監測特別重要。通過血液中腫瘤標誌物，如ctDNA ppm來間接反映藥物反應，是一個有效指標。
你的研究也想做NeXT 高靈敏ctDNA分析嗎?
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